Enviar Jobs
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A continuación se muestra una lista con los comandos de Slurm más usados:
- Para enviar un batch job a la cola de slurm ejecutaremos
sbatch.
sbatch ejemplo.sh
- Para listar los jobs que he enviado a la cola usaremos
squeue.
squeue --me
- Para cancelar un job en ejecución usando su job ID emplearemos
scancel.
scancel 78910
- Para revisar el estatus de un job usaremos
saccty le pasaremos un job ID.
sacct -j 78910
- Para revisar cuan eficientemente un job se ejecuta, emplearemos
seffacompañado del job ID.
seff 78910
- Para ejecutar un job de manera interactiva emplearemos
srun
srun --pty -t 2:00:00 --mem=8G -p interactive bash
Las siguientes opciones modifican el tamaño, largo y el comportamiento del job que se envía. Estos pueden especificarse llamando a srun o sbatch, o dentro de un batch job. Si se especifican las opciones en los argumentos de sbatch y en el script del batch job al mismo tiempo, las opciones pasadas al comando sbatch serán las que se tomarán en cuenta. Si no se especifica valor para alguna de las opciones, los valores por defecto serán los que se empleen.
| Opción Larga | Opción Corta | Valor por Defecto | Descripción |
|---|---|---|---|
--job-name | -J | Nombre del archivo | Nombre de job personalizado. |
--output | -o | "slurm-%j.out" | Nombre del archivo donde se guadará la salida stdout o stderr. Mayores patrones de nombre aquí. |
--error | -e | Se escribe en el mismo archivo del --output | Nombre del archivo donde se guadarán los logs de ;ps errores. |
--partition | -p | Varía de acuerdo al cluster | Señala la partición donde se va a ejecutar el job. |
--account | -A | El nombre de su grupo | Especifica si se tiene acceso a múltiples particiones privadas. |
--time | -t | Varía de acuerda a la partición | Límite de tiempo para el job en el formato D-HH:MM:SS. Por ejemplo, -t 1- es un día de ejecución y -t 4:00:00 son 4 horas. |
--nodes | -N | 1 | Número total de nodos. |
--ntasks | -n | 1 | Número de tareas (workers MPI). |
--ntasks-per-node | El scheduler lo decide | Número de tareas por nodo. | |
--cpus-per-task | -c | 1 | Número de CPUs para cada tarea. Use esto para threads/cores en un job de nodo único. |
--mem-per-cpu | 5G | Cantidad de memoria RAM requerida por CPU en MiB. Si se especifica en GiB usar G(ej. 10GB). | |
--mem | Memoria pedida por nodo en MiB. Si se especifica en GiB usar G(ej. 10GB). | ||
--gpus | G | Usado para pedir GPUs. | |
--constraint | C | Restricciones a las características del nodo. Para limitar los tipos de nodos a ejecutarse. | |
--mail-user | Tu email de UTEC | Dirección de correo a donde enviar notificaciones del job. | |
--mail-type | Ninguna | Envía un mail cada vez que un job cambia de estado. Utilice la opción ALL para recibir notificaciones al iniciar y terminar un job. Opciones disponibles ALL, BEGIN, END, FAIL, NONE |