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Envío de Jobs
Comandos básicos de SLURM

Comandos básicos de SLURM

srun - Ejecutar trabajos

El comando srun es utilizado para ejecutar jobs de manera directa o interactiva. Se puede especificar cuántos nodos, CPUs, memoria, etc., se requiere utilizar.

Sintaxis básica:

srun [opciones] [comando]

Ejemplo: Ejecutar un script en un solo nodo con una CPU:

srun -n 1 --ntasks=1 --cpus-per-task=1 bash mi_script.sh

Donde mi_script.sh contiene lo siguiente:

#!/bin/bash

echo "Iniciando en $(date)"
echo "El job fue enviado a la partición ${SLURM_JOB_PARTITION}"
echo "Nombre del job: ${SLURM_JOB_NAME}, Job ID: ${SLURM_JOB_ID}"
echo "Tengo ${SLURM_CPUS_ON_NODE} CPUs en el nodo $(hostname)"
echo "Voy a dormir 10s para que me veas en la fila"
sleep 10

Al pedir un job interactivo, se reservaran los recursos y se iniciará sesión en un shell de alguno de los nodos de cómputo.

Ejemplo: Reservar un nodo de manera interactiva:

srun --pty -t 2:00 --mem=2G -p debug bash

El comando anterior asignará un CPU y 2GiB RAM por un periodo de 2 minutos. Durante ese tiempo podremos ejecutar comandos dentro de la shell de manera interactiva. Para salir de la sesión, deberemos ejecutar exit o presionar Ctrl+d.

sbatch - Enviar trabajos a la cola

El comando sbatch se utiliza para enviar un trabajo a la cola de SLURM. Este comando es ideal para trabajos que se ejecutan en segundo plano, como tareas largas o de alto rendimiento.

Sintaxis básica:

sbatch [opciones] [archivo_de_script]

Ejemplo: Enviar un trabajo de script:

sbatch mi_script.sb

squeue - Ver el estado de los trabajos

El comando squeue muestra los trabajos en ejecución y en espera en la cola de SLURM. Con ese comando nuede ver el estado de tus trabajos, qué partitición y nodos están utilizando, etc.

Sintaxis básica:

squeue [opciones]

Ejemplo: Ver los trabajos que he enviado:

squeue --me

Con ello obtendré una salida parecida a:

[alan.turing@khipu ~]$ squeue
JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)
1077     debug  CudaJob  alan.turing  R       0:02      1 n005

scancel - Cancelar trabajos

Este comando te permite cancelar trabajos en ejecución o en espera en la cola.

Sintaxis básica:

scancel [opciones] [job_id]

Ejemplo: Cancelar un trabajo con un ID específico:

scancel 1077

scontrol - Controlar y gestionar trabajos

El comando scontrol le permite obtener información detallada sobre trabajos o recursos, y realizar operaciones de control (pausar, reanudar, etc.).

Sintaxis básica:

scontrol [opciones] [comando]

Ejemplo: Ver el estado de un trabajo:

scontrol show job 1077

Con ello obtendré una salida parecida a:

[alan.turing@khipu ~]$ scontrol show job 1077
JobId=1077 JobName=CudaJob
   UserId=alan.turing(1000) GroupId=alan.turing(1000) MCS_label=N/A
   Priority=1683 Nice=0 Account=pregrado QOS=a-pregrado
   JobState=COMPLETED Reason=None Dependency=(null)
   Requeue=1 Restarts=0 BatchFlag=1 Reboot=0 ExitCode=0:0
   RunTime=00:00:02 TimeLimit=00:10:00 TimeMin=N/A
   SubmitTime=2024-11-06T02:41:48 EligibleTime=2024-11-06T02:41:48
   AccrueTime=2024-11-06T02:41:48
   StartTime=2024-11-06T02:41:48 EndTime=2024-11-06T02:41:50 Deadline=N/A
   SuspendTime=None SecsPreSuspend=0 LastSchedEval=2024-11-06T02:41:48 Scheduler=Main
   Partition=debug AllocNode:Sid=khipu:2943597
   ReqNodeList=(null) ExcNodeList=(null)
   NodeList=n005
   BatchHost=n005
   NumNodes=1 NumCPUs=1 NumTasks=1 CPUs/Task=1 ReqB:S:C:T=0:0:*:*
   ReqTRES=cpu=1,mem=100M,node=1,billing=1
   AllocTRES=cpu=1,mem=100M,node=1,billing=1
   Socks/Node=* NtasksPerN:B:S:C=0:0:*:* CoreSpec=*
   MinCPUsNode=1 MinMemoryCPU=100M MinTmpDiskNode=0
   Features=(null) DelayBoot=00:00:00
   OverSubscribe=OK Contiguous=0 Licenses=(null) Network=(null)
   Command=/home/alan.turing/gpu_job_shard.sh
   WorkDir=/home/alan.turing
   StdErr=/home/alan.turing/slurm-1077.out
   StdIn=/dev/null
   StdOut=/home/alan.turing/slurm-1077.out
   Power=

sinfo - Ver información sobre los nodos y particiones

Con sinfo puede obtener información sobre las particiones, su estado y nodos disponibles en el sistema.

Sintaxis básica:

sinfo [opciones]

Ejemplo: Ver el estado de las particiones:

sinfo

Ejemplo: Ver el estado de las particiones y la razón de dicho estado:

sinfo -R
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